应该说，宋元明清四朝的大多数儒家学派，大多数属于三教合一型。

理学中的程朱学派和陆王学派，都是三教合一型的学派。

程朱学派的基本力量是伊川学派和考亭学派。伊川学派因程颐号伊川而得名，考亭学派因朱熹在福建建阳考亭讲学而得名。以程颢为代表的明道学派，因程颢号明道而得名，但程颢更多地表现出心学倾向，既以理为宇宙本源，又以人心之仁为理之体现，为后来陆九渊、王守仁开启了心学之源。程朱学派普遍带有三教合一的色彩，明道学派也不例外。

程颢从十五六岁开始闻周敦颐论学，泛滥于诸家，出入于老、释者几十年，返求诸《六经》，而后得之”。程颢坦然表白“吾学虽有所授受，‘天理’二字却是自家体贴出来”。黄百家评论“天理”二字说：“盖吾儒之与佛氏异者，全在此二字。吾儒之学，一本乎天理。而佛氏以理为障，最恶天理。先生少时亦曾出入老、释者几十年，不为所染，卒能发明孔、孟正学于千四百年无传之后者，则以‘天理’二字立其宗也”。但是，程颢的心性之学和悟的思想，显然有融合中国佛教的内容，诚如叶适所言，程颢所言“皆老、佛、庄、列常语”，虽“攻斥老、佛至深，然尽用其学而不自知”。当然，对这种现象，也可以用钱穆的话加以解释，“不入虎穴，焉得虎子，明道盖于老释异端，用心特深，故能针对老释而发扬孔子之大道与儒学之正统，其事端待明道而始著”。但这种解释并不否认程颢对佛教确有继承与融会处。

程颐的思想虽与其兄有异，但受佛教影响却是与其兄一致的。他经常瞑目静坐，虽有“世言伊川终生不看佛书”之说，但其心性学说，禁欲主义，均与佛教有渊源关系。和二程有渊源关系的诸多学派如北宋和靖、豫章，南宋汉上、西山、湖湘、武夷、玉山、荥阳、五峰、南轩等，也大多带有三教合一的倾向。

以朱熹为代表的考亭学派，或称闽学、晦翁学派，该派的三教合一倾向也极为明显。朱熹“出入于释老者十余年”，他虽然表白自己“于释氏之说，盖尝师其人，尊其道，求之亦切至矣，然未能有得”，并批判佛教空虚寂灭，义理灭尽，“禅学最害道”，“大而万事万物，细而百骸九窍，一齐都归于无。终日吃饭，却道不曾咬着一粒米，满身著衣，却道不曾挂着一条丝”，因此“异端之害道，如释氏者极矣”。但是，谁也不会否认，华严宗一即一切、四法界之说都影响到朱熹的理一分殊说，朱熹的理一分殊还借用佛教的月印万川之喻来说明：“释氏云‘一月普现一切月，一切水月一月摄’，这是那释氏也窥见得这些道理”。而人人有一太极，物物有一太极的学说，朱熹则是借鉴了华严宗的因陀罗网境界。朱熹的一多关系论“一理之实而万物分之以为体”、“万个是一个，一个是万个”，是佛教禅宗“一法遍含一切法”的翻版；而其一旦豁然贯通的工夫，则是脱胎于禅宗的顿悟说。受考亭学派影响，南宋巽斋、定川、北溪、木钟、东发、勉斋、鹤山，宋元之际鲁斋，元代静修、萧同，明代崇仁、河东各学派，也都自然地带有三教合一的倾向。

陆王心学同样也是三教合一型的儒家学派。陆学在当时已被宗朱者诋为“狂禅”，陈北溪指出“象山教人终日静坐，以存本心，……今指人心为道心，便是告子生之谓性之说；蠢动含灵，皆有佛性之说；运水搬柴，无非妙用之说”。王阳明更是深受佛教、道家影响，他“始泛滥于辞章，继而遍读考亭之书，循序格物，顾物理吾心，终判为二，无所得入。于是出入于佛老者久之。及至居夷处困，动心忍性，因念圣人处此，更有何道。忽悟格物致知之旨：圣人之道，吾性自足，不假外求。其学凡三变而始得其门”。

这里并未详细论及程朱、陆王受道家影响之处，原因是：其一，中国佛教本身是印度佛教不断中国化而形成的，印度佛教在中国化的过程中，已经吸收或融会了道家或道教的内容，这是一个基本的事实；其二，朱、陆之间发生了长达数年有关无极、太极的辩论，已经明确地揭示出他们都有受道家影响之处，因此，有人指出“于太极上加无极二字，乃是蔽于老氏之学”，无极之学“其来历为老氏之学明矣”。

后世受到陆王影响的学派，如南宋慈湖、元代静明、宝峰，明代白沙、甘泉、泰州、江右、蕺山，清代康有为、谭嗣同，也都有三教合一的特点。至于和会朱陆的各派，如南宋晦静、深宁，元代草庐，明代东林，清初颜李，自然也有这种特点。

综上所述，宋明理学中的大多数学派，虽然都是属于儒家学派这一范畴的，但他们都是三教合一型的儒家。正如任继愈所说：“周、程、张、朱、陆、王诸大家，在青少年时期都有‘出入于佛老’的治学经历”；“如果仔细考察，会发现宋、明诸儒并没有真正反对佛教，倒是可以认为他们是佛教的直接继承人。也可以说，他们是接着佛教的一些中心问题，沿着他们的路线继续前进的”。这可以说是不移之论。