《七篇》认为，气是宇宙的本元，气的升降相因，交错相感是产生自然界一切事物及现象的根源。《六微旨大论》说：“气之升降，天地之更用也”，“天气下降，气流于地，地气上升，气腾于天；故高下相召，升降相因，而变由作矣。”自然界一切气候现象都是由“五运”和“六气”两个“气象要素系统”交错叠加，经过自然的综合而形成的。这种运气交错叠加有着相对的稳定性和变动性。如果运气和时序主岁大致相合则气候谐和，风调雨顺，反之则时序错乱导致灾变。故《五运行大论》说：“上下相遘，寒暑相临，气相得则和，不相得则病”，“从其气则和，逆其气则病。”

宋代科学家沈括在《梦溪笔谈》中有一段极好的记述：“大凡物理，有常有变。运气所主者，常也；异气所主者，皆变也。常则如本气，变则无所不至，而各有所占。故其候有从、逆、淫、郁、胜、复、太过、不及之变，其发皆不同。若厥阴用事，多风而草木荣茂，是谓之从，天气明洁，燥而无风，此之为逆，太虚埃昏，流水不冰，此之谓淫；大风折木，云物浊扰，此之谓郁；山泽焦枯，草木凋落，此之谓胜；大暑燔燎，螟蝗为灾，此之谓复；山崩地震，埃昏时作，此之谓太过；阴森无时，重云昼昏，此之谓不足。随其所变，疾疠应之，皆视当时当处之候。”运气的变化常中有变，变中有常，“时有常位而气无必也。”它提示人们应该把握运气的变化规律。“和其运，调其化，使上下合德，无相夺伦，天地升降，不失其宜”（《六元正纪大论》），即令人体和调于运气的生化规律，适应天地升降之宜，才能保持康泰；倘若违背了它，就难免不招致疾病。

“气相得则和，不相得则病”，概括地说明了自然界气运的谐调与否和气候、物候、病候的常变密切相关。所谓“非其位则邪，当其位则正”，即气候与季节相应的为“当位”，见气候平顺，反之即是“非其位”，成为致病之邪（非时之气）。明·张介宾对此句有进一步的发挥，他从自然界气的运动变化联系到人体的气化。他说：“气之在人，和则为正气，不和则为邪气”，“故其在外有六气之候，在内则有九气之乱，而凡病之为虚为实为热为寒……盖气有不调之处，即病本所在之地也。”（《景岳全书》）六气的太过、不及，即成致病之“六淫”、情志内伤令气机失调，邪从内生。这一点，《七篇》与《举痛论》所提出的“百病生于气”的观点遥相呼应，也是“气—元论”哲学思想的生动体现。