毒性甲状腺腺瘤手术治疗的效果最好，如果腺瘤切除干净，且没有转移，术后用甲状腺片替代治疗，预后一般是好的。毒性结节性甲状腺肿手术治疗的效果比药物治疗的效果好，复发病例比较少。毒性弥漫性甲状腺肿手术治疗的效果也明显好于药物治疗，甲亢的复发率很低；经药物治疗复发的病例，用手术治疗往往可以使甲亢治愈。

采用甲状腺手术治疗甲亢，往往能取得较好的疗效。毒性甲状腺腺瘤患者经手术切除甲状腺腺瘤后，一般不出现病情复发。毒性结节性甲状腺肿患者一般采用甲状腺大部切除术的治疗方法，预后较好，复发的病例较为少见。毒性弥漫性甲状腺肿患者经甲状腺大部分切除后，治愈率均达９０%，复发率仅为２%～８%，复发的病例在术后１～５年内出现，但也有少数病例在１０年以后出现。抗甲状腺药物治疗后复发的毒性弥漫性甲状腺肿患者，如果继续服用抗甲状腺药物治疗，再次复发的比例很高，提示这种患者不宜再用药物治疗，如果改用甲状腺手术治疗，仍可有较好的疗效，再次复发的病例很少。

垂体性甲亢即垂体TSH腺瘤患者，由于病变部位是垂体，用甲状腺手术治疗的效果不好，术后复发的比例极高。因此，这种病例，不应采取甲状腺手术治疗。