器质性便秘是指由于脏器的器质性病变(如消化道疾病、内分泌代谢疾病、药物及化学品中毒、神经系统疾病等)所致的便秘。例如肠粘连及不完全肠梗阻的病人，均可发生便秘，这种便秘就属于器质性便秘。

患器质性便秘的病人，必须重视原发病的治疗，否则，便秘最终不会得到解决。