拉萨的甘丹寺、色拉寺和哲蚌寺合称三大寺．甘丹寺在拉萨市郊的达孜县境内,是宗喀巴于明永乐七年(公元1409年)兴建的第一座格鲁派寺院．全寺分夏孜、绛孜两个扎仓．僧人定额为3300 人．寺院规模相当于三个布达拉宫．主要建筑为拉基大殿、赤多康等．拉基大殿可同时容纳300O 多个喇嘛在内诵经．赤多康是宗喀巴生前起居之处,内间有一台坐床,据说宗喀巴就是在这床上圆寂的．宗喀巴的法座继承人、历代格鲁派教主称为＂甘丹赤巴＂,他们世世住在这所寺里,灵塔也保存在此。

色拉寺在拉萨市北五公里,是宗喀巴的弟子绛钦却杰(大慈法王)释迦也失所建．他曾于明永乐十二年(公元1414年)和宣德九年(公元1434年)先后两次到北京觐见皇帝,被封为大国师和大慈法王,得到明廷的厚赐．寺宇倚山面河,规模宏大．17 世纪时僧员定额为5500 人．到1959年时寺僧达9000 人．主殿为措钦大殿,面积有1000 多平方米,共四层,殿内壁画完好．寺内分节扎仓、麦扎仓和阿巴扎仓．所藏文物也很丰富,有释迦也失从北京带回的大藏经、各种佛像、唐卡、金银铜的法器和供器等。

哲蚌寺在拉萨市西北10 公里．是宗喀巴的弟子绛央却杰所建．全寺建筑以白色为主调,远望如米堆,所以取名＂哲蚌寺＂,意为积米寺．占地面积为25 万平方米．殿宇依山而起,联成一座山城．五世达籁时僧人定额7700人,解放前夕僧人已超过一万,是喇嘛教最大的寺院．正殿措钦大殿面积1850平方米,前面还有2000 平方米的广场,殿内可同时容纳六七千人．另有＂噶丹颇章＂,意为极乐宫．三世、四世、五世达籁都住在这里,直到布达拉宫峻工后,才移居布达拉宫．五世达籁曾在这里建立噶丹颇章王朝,哲蚌寺便一度成为西藏地方政权的中心,所以历世达籁都以哲蚌寺为母寺．寺内扎仓规模超过其他寺庙,藏书丰富。

格鲁教派的另一座大寺拉卜楞寺在甘肃夏河县,是甘南藏族地区的最大寺院,下辖寺院108 所,喇嘛总数达两万名,始建于清康熙四十八年(公元1709年),僧舍有万余间．寺内有能煮四头大牛的铜锅,五尺长的象牙．珍藏文物几万件,藏文经典、书籍六万多册．因而与塔尔寺、扎什伦布寺和拉萨三大寺并称为黄教六大寺院。