中华水下考古学会筹备会的潜水专家成员，在2002年7月，在澎湖东吉岛附近海域发现了一座水底古石墙的遗迹，成为台湾海域附近继虎井沉城之后最受瞩目的一个疑似古沉城遗迹。　

这座疑是人为建造物的水下石墙的年代、整体建筑原来形貌、功能不明，至于它到底是人造建筑抑或自然形成的海下产物，都还是个谜。石墙发现后，有人推测它的年代在六千年以前，有的推测在一万年以前。

这些考古上的问题，都有待学界，尤其是考古的城址专家作更进一步研究判断。

这座疑似人工建筑而成的石墙，在东吉屿西北侧，水深二十五米至三十米之间。石墙的平均高度约一公尺，宽度约五十公分左右，长度约一百米，呈东西走向。根据声纳扫描资料显示，这里有同样的墙约四至五道。潜水人员实地探勘并发现，墙面部分的小凹洞还夹杂着小卵石。

潜水人员发现的这个结果，部分专家推测这是人工建筑的石墙，也可能是古代城墙的一部分遗迹。尤其，台湾附近海域第一座沉城遗址，1976年发现的虎井沉城，与这个新的水下发现相隔仅一百里左右，两个遗迹之间的关联引人遐想。曾有人推估虎井沉城年代可能在七千至一万年前。