肛瘘的内口是初起感染生成肛瘘的入口,是发病的起源,因此,肛瘘都有其内口,同时,瘘管长期不能愈合,充分证明有病灶内口的存在。手术中的观察也证实了这点。

一般来说,绝大多数内口在肛窦内及其附近,集中在肛管后正中部两侧发病。内口可在直肠下部或肛管的任何部位,但多在内外括约肌连接处的平面上。有的有二处内口,一在肛管,一在直肠。临床中,若内口在直肠下部,表示瘘管复杂,手术操作较困难；若同一平面上有两个内口时,表示有两个瘘管,各有内口通入肛管。一般内口较小、圆形,在齿线附近可摸到变硬的凹陷；有的内口较大,形状不规则；内口较大的多为结核性肛瘘。

肛瘘的内口处理是治疗的关键所在。手术时如找不到内口,或内口处理失当,瘘管则不能完全治愈。即便有时伤口暂时愈合,因入口仍然存在,感染时仍易复发,形成肛瘘。因此,在手术之前,一定要仔细检查肛瘘的内口,完全切除或切开它,才能彻底治愈肛瘘。