森田把住院治疗时间规定为40天，而现在，森田治疗的实施者根据自己的经验，公认40天时间过短，现代住院时间大致为3个月。

在现代化社会中，让患者接受治疗的方法，去忍受痛苦常常必须增加解释的次数，甚至并用抗焦虑药。在作业的内容上，也多数把绘画疗法、音乐疗法、娱乐疗法、体育疗法等等应用到作业中去，使之与现代生活相适应。

森田把第2期至第4期严格区分开，新森田疗法的多数，采用森田疗法的理论，但各期没有严格的界限，仍然有明显效果。 森田提倡“日日是好日”，“日新又一新”。对此，森田解释为“工作和学习的一天则是好日，否则就是不好的一天”。不被情绪所束缚，过着对人生有目的的生活。“日新又一新”是说今日比昨日，明日比今日是更有意义的人生。今日是新的一天，它包含着无止境的创造性。

新森田疗法不仅限于治疗神经症，而适应症在不断地扩大。例如，药物依赖、酒依赖、精神分裂症、抑郁症等等，都得到治疗效果。(对于后2种疾病的患者，主要是进入缓解期以后)。这些患者采用森田疗法，不是正规地由绝对卧床开始，而是从作业期开始。

在采用森田疗法的过程中，还应用家庭治疗，在调整家庭成员的关系上下功夫。因为新森田疗法学派认为，神经症的病因与家庭内动力有关，这样既提高了疗效，又扩大了森田疗法的应用范围。