过去认为，大多数慢性肾盂肾炎由急性肾盂肾炎治疗不彻底反复发作而致。近年来，对于二者之间的关系有了新认识，认为两者之间关系并不象以前所说的那样重要，对于慢性肾盂肾炎的诊断标准已有所修正。据文献报告，本病占全部肾盂肾炎的7%～20%，仅半数病人有急性肾盂肾炎的发作史。本病临床表现复杂，症状多端。其主要表现是真性细菌尿，尿中仅有少量白细胞和蛋白，细菌尿可为持续或间歇性。患者多有反复发作的尿路刺激症状。部分病人既无全身症状，又无明显尿路刺激症状。有些病人有腰痛、低热、乏力、尿频或反复检查出现脓尿等。有时仅有食欲不振、面色萎黄、倦怠，小儿表现为发育不良、厌食、贫血、精神萎靡、生长迟缓或遗尿、尿失禁等。

另一部分病人，由于体内存在易感因素如尿路结石、尿路畸形等，此类病人常反复发作久治不愈，并有不同程度的肾功能损害。慢性肾盂肾炎临床表现虽较急性肾盂肾炎轻，尿液改变也不如急性肾盂肾炎明显，但仔细检查仍有肾区叩击痛、肋腰点压痛等阳性体征。当炎症侵犯肾实质时，可出现高血压、水肿、肾功能障碍。由于慢性肾盂肾炎病变主要在肾髓质和乳头部，故肾小管的功能常先受累，早期主要表现为肾小管功能减退，如尿路浓缩功能不良而出现多尿症状，酚红排泄率降低，偶可引起失钠失钾性肾病或肾小管性酸中毒。病情继续发展，在晚期可有贫血及血尿素氮升高，最后出现尿毒症。有一些单纯性慢性肾盂肾炎患者，可以肾功能衰竭为其第一个临床表现。

南通医学院钱桐荪教授曾将慢性肾盂肾炎的临床表现归纳为五种类型，即：

⑴、长期低热型　患者无尿路刺激症状，仅有低热、头昏、疲乏无力、体重减轻及食欲减退等一般症状，易误诊为神经性低热、结核病或其它慢性感染性疾病。

⑵、反复发作型　此型为典型慢性肾盂肾炎，病人经常反复发生尿路刺激症状，伴有菌尿。常有低热或中等热度，肾区钝痛。诊断多无困难。

⑶、血尿型　少数病人以反复发作性血尿为特征，尿色暗红而混浊，多伴有腰背酸痛或有轻度尿路刺激症状。血尿可自行缓解。

⑷、高血压型　病人既往可有尿路感染病史，但主要临床表现是以头昏、头痛及疲乏为特征的高血压症状，或偶尔检查发现有高血压，而无尿路刺激症状，可有间歇性菌尿或无菌尿。因此，极易误诊为特发性高血压病。本病是急进型高血压病的基础疾病之一，遇到青壮年妇女患高血压者，应考虑到慢性肾盂肾炎的可能。患者可伴有蛋白尿和贫血，肾小球滤过率降低。

⑸、无症状性菌尿　患者既无全身症状，又无尿路刺激症状，而尿中常有多量的细菌、少量白细胞，偶见管型。此型多见于妊娠妇女及女孩。